正面の石垣と通路を挟んだ左側の石垣との間に二ノ門がありました。二ノ門は階下に門、階上に長屋をのせた櫓門で、両脇の石垣上にはその長屋に接して塀を廻らせていました。記録には「渡門」「廣サ 二間 三間 四方」とあります。
この門をくぐると高い石垣で方形に囲まれた空間が設けてあり、進路を阻む構造となっています。これは敵の侵入を封じ込めるとともに出撃の際に兵を待機させる等、攻守に強固な機能を備えています。
この様な出入口を一般に桝形虎口と呼び、近世城郭を構成する要素の一つとされています。浜田城では本丸の正面に位置する二ノ門にしか、この様な構造を採用しておらず、重要な城門といえます。