由鐮倉時代至安土桃山時代約400年間，志岐城係擁有下天草北半部分嘅志岐氏嘅居城。
有本丸、二之丸、出丸、練馬場，南面嘅深山有豎溝，北面往侍町伸廷，外面係海，東面係深谷，底有河，溝邊有岩石，係一個難以攻陷嘅堅城。
志岐氏最後嘅頭目志岐麟泉，係喺天草初次為基督教傳教天草5人眾嘅首領，但喺1589年，被小西行長同加藤清正嘅聯軍攻擊，依靠薩摩嘅島津氏往出水逃走。
志岐城跡依家仍然留有少少昔日嘅面貌。