志岐城は鎌倉時代から安土桃山時代までの約400年間、下天草の北半分を領有していた志岐氏の居城でした。
本丸、二の丸、出丸、馬場があり、南は深い山に竪堀り、北は侍町へ続き、その外は海、東は深い谷、底は川、堀際は岩で、難攻不落の堅城でした。
志岐氏最後の頭首、志岐麟泉は天草で初めてキリスト教を布教するなど、天草５人衆のリーダー的存在でしたが、1589年、小西行長、加藤清正の連合軍に攻められ、薩摩の島津氏を頼って出水に逃れました。
志岐城跡は今は昔日の面影をわずかに残しています。